Die antike Stadt Thera (manchmal auch Thira geschrieben) lag an der Südostküste der griechischen Insel Santorin, auf dem unzugänglichen Kamm des steilen, 360 Meter hohen Mesa Vouno. Die Stadt Thera ist jedoch nicht zu verwechseln mit der heutigen Hauptstadt Fira, die auf der Westseite der Insel liegt.

Die Stadt hat ihren Namen von dem mythischen Herrscher der Insel, Theras, dem Sohn des Königs von Theben. Im 9. Jahrhundert v. Chr. kamen Kolonisten aus Sparta auf die Insel Kallistos (wie Santorin auch genannt wurde) und beschlossen, die strategische Lage des hohen Berges im Südosten der Insel zu nutzen. Sie nannten dann die Stadt und die Insel Thera zu Ehren ihres Königs. Diese zunächst unbedeutende Siedlung erlangte bald den Ruf der "Mutterstadt" von Kyrene (einer antiken Siedlung an der Nordküste Afrikas, die um 630 v. Chr. von den Bewohnern der Insel Thera gegründet wurde).

Durch das Stadtzentrum führte eine lange und relativ breite Straße, die hauptsächlich von öffentlichen Gebäuden gesäumt war. Die Wohngebäude gruppierten sich um die Agora (das Wort "Agora" bezieht sich auf den Versammlungsort im Zentrum der antiken Stadt, an dem sich das öffentliche Leben abspielte), der östliche Teil der Hochebene war für Tempel und andere sakrale Gebäude vorgesehen, und hoch oben in den Bergen befand sich die Garnison. Alle Gebäude wurden aus dem Kalkstein des Berges selbst errichtet; Holz war selten und wurde daher nur selten als Baumaterial verwendet. Die Stadt verfügte auch über einen Hafen.

Die Rolle der Stadt änderte sich in der zweiten Hälfte des 3. Jahrhunderts v. Chr., in der so genannten hellenistischen Periode, als die ptolemäische Kriegsflotte für die gesamte Ägäis in den Hafen der Stadt verlegt wurde. Die Stadt wurde komplett neu aufgebaut, um den Bedürfnissen der Offiziere gerecht zu werden, einschließlich des Baus einer Werft und von Unterkünften für Matrosen und Soldaten. Die Flotte lag hier bis etwa 140 v. Chr. vor Anker.

In der Zeit der römischen Herrschaft, die etwa auf die Mitte des 1. Jahrhunderts v. Chr. datiert werden kann, waren die Stadt und die Insel Teil der römischen Provinz Asia, und obwohl keine hochrangigen Beamten auf der Insel lebten, konnte die Stadt ihren Wohlstand und ihre große Bedeutung bewahren. Nach dem 2. Jahrhundert n. Chr. kam ein neuer Glaube auf die Insel - das Christentum. Die Stadt Thera blieb bis 726 n. Chr. bewohnt, als es zu einem kleineren Ausbruch des Vulkans Santorin kam und die Einwohner auf der Suche nach einem bequemeren Leben an die Küste der Insel zogen.

Die ersten archäologischen Ausgrabungen in diesem Gebiet fanden an der Wende vom 19. zum 20. Jahrhundert statt und wurden in den 1960er Jahren von N. Zapheiropoulos unter der Schirmherrschaft der Archäologischen Gesellschaft von Athen fortgesetzt, der mit seinem Team die städtische Nekropole von Sellada am Rande der heutigen Stadt Kamari freilegte (eine Nekropole ist eine besondere Art von historischer Begräbnisstätte, der Name stammt aus dem Griechischen und bedeutet "Stadt der Toten"). In den 1990er Jahren wurden die Ausgrabungen unter der Leitung des deutschen Archäologen Wolfram Hoepfner wieder aufgenommen, und die archäologische Stätte von Thira ist heute eines der wichtigsten Monumente von Santorin. Funde aus den archäologischen Ausgrabungen können im Archäologischen Museum von Thera oder beispielsweise im Archäologischen Nationalmuseum in Athen besichtigt werden.