Die Ursprünge des ursprünglichen Klosters von Agios Nikolaos gehen auf das Jahr 1651 zurück, als die Familie Gyzi, eine der wenigen orthodoxen Familien der Insel, in der venezianischen Burg von Skaros lebte. Die Familie beschloss, ihre Privatkapelle in ein Kloster umzuwandeln und sie dem Heiligen Nikolaus zu weihen. Die Mädchen der Familie Gyzi wurden die ersten Nonnen. In diesem Jahr erteilte der Erzbischof von Santorin die Erlaubnis, das Kloster an einen neuen, besser zugänglichen Ort zu verlegen. Der Bau des neuen Klosters dauerte bis 1820, und das Kloster steht noch heute an dieser Stelle und in dieser Form. In der Mitte des 19. Jahrhunderts ging sie in den Besitz des griechischen Staates über.

Heute befindet sich das Kloster St. Nicholas zwischen den Dörfern Firostefani und Imerovigli, mit einem atemberaubenden Blick auf die überflutete Caldera. Das Klostergebäude besteht aus der St.-Nikolaus-Kirche und 32 Zellen (Zimmer), in denen die Nonnen untergebracht sind. Heute beherbergen die großen Säle des Klosters ein Volkskundemuseum und ein religiöses Museum, in dem seltene byzantinische Ikonen (vor allem die Ikone des Heiligen Nikolaus) und eine prächtige geschnitzte Ikonostase aufbewahrt werden.

Am lebendigsten wird der Ort während der Osterzeit, einem der größten und beliebtesten Feiertage des Jahres in Griechenland, auf den sich die Griechen schon lange im Voraus vorbereiten.

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